Imaris 10.0软件目前有ImarisFileConverter、Imaris Viewer两个免费功能,并购买了Imaris Core、Stitcher、Measurement Pro、ImarisXT四个模块,以下是各功能模块的应用简介:
1、 ImarisFileConverter(免费)
支持将多种数据格式 (包括主流成像设备制造厂商如Nikon、Leica、Zeiss和Olympus)转换为lmaris文件格式
支持多线程、批处理
支持Bio-formats
2、 Imaris Viewer(免费)
支持对多维图像进行渲染
支持打开和展示付费版Imaris处理后的文件。
提供MIP. Blend, Normal Shading, ShadowProjection四种多维渲染模式。
可添加 slicer/Clipping plane等多种展示模式。
可输出图片格式。
支持TB (Terabyte)级别的数据渲染与展示
3、 多维图像拼接Stitcher模块
支持2D、3D、4D多通道图像的拼接
支持TB级别图像拼接
支持自动或手动拼接
4、 多维图像渲染的Imaris Core模块
可对多维数据进行 Normalize /Smooth /Background Subtraction等前处理
提供 MIP, Blend, Normal Shading, Shadow Projection四种多维渲染模式
可添加 Slicer/Clipping plane等多种展示模式
可输出图片或视频格式
支持TB (Terabyte) 级别的数据渲染与展示
5、 多维图像测量Imaris MeasurementPro模块
可测量多维图像中的空间距离,角度,荧光强度分布等
支持TB (Terabyte) 级别的数据分析
交互式渲染大量的Surface对象和数以百万的Spot对象
从复杂大数据中创建Surface和Spot对象
使用机器学习分类或交互式筛选工具对Spot和Surface对象进行分类、标记。
根据识别到的类别来展示和比较参数
在每个通道的基础上测量强度
根据任意计算参数对检测对象进行颜色编码,直观地选择对象提取关键参数。
计算对象之间的距离与重叠区域
与随机分布相比的对象间的吸引和排斥测量
利用二维Contour轮廓线功能进行半自动构建和测量三维物体
6、 可整合导入自编算法的ImarisXT模块
允许使用多种编程语言如Matlab@, Java@, Python@等,对Imaris进行二次开发
已整合超过70种插件(包括三方开发插件),提供更加智能和全面的数据处理和分析。
可通过访问Imaris开放网络平台(https://imaris.oxinst.com/open/)获取更多支持
由Labkit提供支持的机器学习像素分类